MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p5BKT015925

Total Repeats: 362

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015419	TTTA	2	8	43	50	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015419	TAT	2	6	51	56	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015419	ATA	2	6	64	69	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015419	TGAA	3	12	118	129	50 %	25 %	25 %	0 %	331268175
5	NC_015419	AT	3	6	206	211	50 %	50 %	0 %	0 %	331268175
6	NC_015419	ACA	2	6	241	246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331268175
7	NC_015419	AT	3	6	260	265	50 %	50 %	0 %	0 %	331268175
8	NC_015419	AT	3	6	271	276	50 %	50 %	0 %	0 %	331268175
9	NC_015419	TAA	2	6	296	301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268175
10	NC_015419	AT	3	6	314	319	50 %	50 %	0 %	0 %	331268175
11	NC_015419	ACA	2	6	328	333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331268175
12	NC_015419	TAA	2	6	348	353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268175
13	NC_015419	CAA	2	6	403	408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331268175
14	NC_015419	A	6	6	427	432	100 %	0 %	0 %	0 %	331268175
15	NC_015419	ATAA	2	8	444	451	75 %	25 %	0 %	0 %	331268175
16	NC_015419	TTA	2	6	513	518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015419	AGG	2	6	522	527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015419	AAT	2	6	536	541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015419	AAG	2	6	564	569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015419	AGCAA	2	10	574	583	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_015419	ATTAT	2	10	604	613	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015419	CTA	2	6	640	645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015419	CATTT	2	10	646	655	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_015419	AT	3	6	703	708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015419	TAA	2	6	719	724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015419	AAG	2	6	725	730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015419	TAT	2	6	745	750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015419	ACA	2	6	762	767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015419	TGT	2	6	809	814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015419	TCT	2	6	824	829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015419	TTG	2	6	850	855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015419	T	6	6	862	867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015419	TG	3	6	873	878	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015419	CCT	2	6	890	895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_015419	AAT	2	6	900	905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015419	TG	4	8	932	939	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015419	AT	3	6	953	958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015419	TCT	2	6	964	969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015419	CTTA	2	8	1017	1024	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_015419	TAAA	2	8	1054	1061	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015419	CT	3	6	1074	1079	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015419	TA	3	6	1097	1102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015419	TAAT	2	8	1136	1143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015419	ACAA	2	8	1208	1215	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_015419	ATTC	2	8	1256	1263	25 %	50 %	0 %	25 %	331268176
46	NC_015419	TTG	2	6	1287	1292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331268176
47	NC_015419	TTG	2	6	1296	1301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331268176
48	NC_015419	T	6	6	1316	1321	0 %	100 %	0 %	0 %	331268176
49	NC_015419	ATAC	2	8	1376	1383	50 %	25 %	0 %	25 %	331268176
50	NC_015419	TTA	2	6	1385	1390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268176
51	NC_015419	TCTAT	2	10	1420	1429	20 %	60 %	0 %	20 %	331268176
52	NC_015419	ATTGG	2	10	1450	1459	20 %	40 %	40 %	0 %	331268176
53	NC_015419	ATT	2	6	1476	1481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268176
54	NC_015419	ATCT	2	8	1497	1504	25 %	50 %	0 %	25 %	331268176
55	NC_015419	TTTA	2	8	1509	1516	25 %	75 %	0 %	0 %	331268176
56	NC_015419	ATT	2	6	1537	1542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268176
57	NC_015419	TTTAG	2	10	1561	1570	20 %	60 %	20 %	0 %	331268176
58	NC_015419	AAT	2	6	1617	1622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268176
59	NC_015419	ATCT	2	8	1628	1635	25 %	50 %	0 %	25 %	331268176
60	NC_015419	TCA	2	6	1639	1644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331268176
61	NC_015419	TTG	2	6	1671	1676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331268176
62	NC_015419	TTTTA	2	10	1716	1725	20 %	80 %	0 %	0 %	331268176
63	NC_015419	T	6	6	1749	1754	0 %	100 %	0 %	0 %	331268176
64	NC_015419	CT	3	6	1757	1762	0 %	50 %	0 %	50 %	331268176
65	NC_015419	TTCTT	2	10	1782	1791	0 %	80 %	0 %	20 %	331268176
66	NC_015419	AAT	2	6	1930	1935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268176
67	NC_015419	ACT	2	6	1986	1991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331268176
68	NC_015419	AATTTA	2	12	2120	2131	50 %	50 %	0 %	0 %	331268176
69	NC_015419	TAT	2	6	2180	2185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268176
70	NC_015419	AATAA	2	10	2205	2214	80 %	20 %	0 %	0 %	331268176
71	NC_015419	TTA	2	6	2254	2259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268176
72	NC_015419	CTA	2	6	2263	2268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331268176
73	NC_015419	ATT	2	6	2283	2288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268176
74	NC_015419	TAT	2	6	2294	2299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268176
75	NC_015419	CTT	2	6	2327	2332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268176
76	NC_015419	ACC	2	6	2409	2414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331268176
77	NC_015419	TTC	2	6	2466	2471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268176
78	NC_015419	ATT	2	6	2484	2489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268176
79	NC_015419	C	6	6	2506	2511	0 %	0 %	0 %	100 %	331268176
80	NC_015419	CAA	2	6	2522	2527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331268176
81	NC_015419	TTGC	2	8	2529	2536	0 %	50 %	25 %	25 %	331268176
82	NC_015419	TA	4	8	2594	2601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015419	ATT	2	6	2602	2607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015419	TA	3	6	2608	2613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015419	TA	3	6	2618	2623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015419	T	6	6	2663	2668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015419	ATTT	2	8	2691	2698	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015419	A	6	6	2724	2729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015419	GTAT	2	8	2747	2754	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015419	ATA	2	6	2783	2788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015419	ACA	2	6	2824	2829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015419	ATT	2	6	2838	2843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015419	ATA	3	9	2844	2852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015419	ATG	2	6	2862	2867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331268177
95	NC_015419	CTT	2	6	2900	2905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268177
96	NC_015419	AT	3	6	2948	2953	50 %	50 %	0 %	0 %	331268177
97	NC_015419	AGT	2	6	2985	2990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331268177
98	NC_015419	CCA	2	6	2995	3000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331268177
99	NC_015419	TTTAAT	2	12	3034	3045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268177
100	NC_015419	CTTA	2	8	3081	3088	25 %	50 %	0 %	25 %	331268177
101	NC_015419	CCT	2	6	3151	3156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	331268177
102	NC_015419	T	7	7	3172	3178	0 %	100 %	0 %	0 %	331268177
103	NC_015419	TTC	2	6	3212	3217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268177
104	NC_015419	AT	3	6	3225	3230	50 %	50 %	0 %	0 %	331268177
105	NC_015419	AAC	2	6	3231	3236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331268177
106	NC_015419	A	6	6	3250	3255	100 %	0 %	0 %	0 %	331268177
107	NC_015419	TTA	2	6	3257	3262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268177
108	NC_015419	TAAT	2	8	3272	3279	50 %	50 %	0 %	0 %	331268177
109	NC_015419	T	6	6	3282	3287	0 %	100 %	0 %	0 %	331268177
110	NC_015419	AT	4	8	3298	3305	50 %	50 %	0 %	0 %	331268177
111	NC_015419	ATA	2	6	3311	3316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015419	TAT	2	6	3333	3338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015419	ATACA	2	10	3365	3374	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_015419	GTT	2	6	3388	3393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015419	AAC	2	6	3405	3410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015419	TACA	2	8	3416	3423	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_015419	CTAG	2	8	3504	3511	25 %	25 %	25 %	25 %	331268178
118	NC_015419	T	6	6	3534	3539	0 %	100 %	0 %	0 %	331268178
119	NC_015419	TTTG	2	8	3546	3553	0 %	75 %	25 %	0 %	331268178
120	NC_015419	TAT	2	6	3589	3594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268178
121	NC_015419	TCA	2	6	3595	3600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331268178
122	NC_015419	TGAT	2	8	3620	3627	25 %	50 %	25 %	0 %	331268178
123	NC_015419	ACTTCC	2	12	3635	3646	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	331268178
124	NC_015419	ATC	2	6	3665	3670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331268178
125	NC_015419	ATGA	2	8	3700	3707	50 %	25 %	25 %	0 %	331268178
126	NC_015419	TA	4	8	3712	3719	50 %	50 %	0 %	0 %	331268178
127	NC_015419	CAA	2	6	3739	3744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331268178
128	NC_015419	CCA	2	6	3750	3755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331268178
129	NC_015419	CCAA	2	8	3779	3786	50 %	0 %	0 %	50 %	331268178
130	NC_015419	AGT	2	6	3818	3823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331268178
131	NC_015419	T	6	6	3907	3912	0 %	100 %	0 %	0 %	331268178
132	NC_015419	CTT	2	6	3916	3921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268178
133	NC_015419	ATT	2	6	4089	4094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268178
134	NC_015419	T	7	7	4102	4108	0 %	100 %	0 %	0 %	331268178
135	NC_015419	ATT	2	6	4129	4134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015419	T	6	6	4133	4138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015419	AT	3	6	4140	4145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015419	GAT	2	6	4148	4153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015419	TA	3	6	4188	4193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015419	ATA	2	6	4200	4205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015419	ATTT	2	8	4233	4240	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015419	TA	3	6	4250	4255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015419	ATT	2	6	4257	4262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268179
144	NC_015419	ATT	2	6	4276	4281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268179
145	NC_015419	TA	3	6	4299	4304	50 %	50 %	0 %	0 %	331268179
146	NC_015419	ATA	2	6	4393	4398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268179
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291	NC_015419	A	7	7	9697	9703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_015419	ATTAA	2	10	9712	9721	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_015419	TAA	2	6	9732	9737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268184
294	NC_015419	TAT	2	6	9747	9752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268184
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302	NC_015419	TTA	2	6	10049	10054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268184
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304	NC_015419	CAC	2	6	10170	10175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331268184
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309	NC_015419	AT	3	6	10583	10588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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311	NC_015419	AT	3	6	10623	10628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
312	NC_015419	TATT	2	8	10631	10638	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
313	NC_015419	CAA	2	6	10643	10648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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315	NC_015419	TTAA	2	8	10723	10730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
316	NC_015419	AT	3	6	10772	10777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
317	NC_015419	AAT	2	6	10779	10784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
318	NC_015419	TA	3	6	10820	10825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
319	NC_015419	T	6	6	10848	10853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
320	NC_015419	AGT	2	6	10929	10934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
321	NC_015419	AT	3	6	10988	10993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
322	NC_015419	TAAAAA	2	12	11011	11022	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
323	NC_015419	ATTT	2	8	11033	11040	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
324	NC_015419	AT	3	6	11163	11168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
325	NC_015419	TA	3	6	11191	11196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
326	NC_015419	TTAT	2	8	11202	11209	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
327	NC_015419	TA	4	8	11213	11220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
328	NC_015419	A	6	6	11223	11228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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349	NC_015419	TTTA	2	8	11926	11933	25 %	75 %	0 %	0 %	331268186
350	NC_015419	CCTT	2	8	11934	11941	0 %	50 %	0 %	50 %	331268186
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362	NC_015419	TTG	2	6	12370	12375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.